4 提交计算¶

push.py 为要运行的脚本名

4.1 直接提交¶

#程序名 脚本名
zdem push.py

优点：实时查看计算是否正确，使用 ctrl+c 结束计算
缺点：关闭窗口，计算停止

警告

这种方式只能作简单测试用，长时间使用会被管理员封号。如果想交互式的提交计算，可采用如下命令 srun -n 1 -c 12 zdem push.py ，即采用1个节点 -n 1 ， 12个核 -c 12 计算。这种方式会正常计费，不会被管理员封号。

4.2 Slurm 作业调度系统¶

并行超算云安装了该调度系统。

SLURM （Simple Linux Utility for Resource Management）是一种可扩展的工作负载管理器，已被全世界的国家超级计算机中心广泛采用。它是免费且开源的，根据GPL通用公共许可证发行。

sbatch job.sh 提交作业
squeue 查看作业状态（可以查看所有作业的id号）
scancel id 取消一个作业（id号定位该作业）

备注

优点：同时计算多个，关闭窗口，不影响计算
缺点：不能实时查看计算情况

4.2.1 提交作业 `sbatch job.sh`¶

显示

Submitted batch job 134573

说明提交成功。 job.sh 内容如下:

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=test
#SBATCH --partition=v6_384
#SBATCH -n 1
#SBATCH -c 12
#SBATCH -t 1440
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err

source /public1/soft/modules/module.sh
source /public1/soft/other/module_zdem.sh
module load zdem2.0

time srun -n 1 zdem push.py
time srun -n 1 zdem2jpg --dir=./data

警告

这里配置 module load zdem2.0 ，将使用 2.* 系列的最新版本。

警告

注意job.sh的行结尾符需采用 Unix 的 \n 格式，否则将产生如下错误信息：

sbatch: error: Batch script contains DOS line breaks (\r\n)
sbatch: error: instead of expected UNIX line breaks (\n).

修改 job.sh 的行结尾符见第00课并行超算云上使用ZDEM 的 10:15

4.2.2 查看作业状态 `squeue`¶

显示

 JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)
134573    v6_384     test  sc80502  R       0:30      1 cb0503

从上面的输出可知，该任务的 id 为 134573 。ST 状态为 R 说明正在计算。任务分配给了节点 cb0503。

小技巧

squeue -l 可以查看作业细节信息

4.2.3 取消作业 `scancel id`¶

要杀死上面的作业，输入 scancel 134573 即可，134573为上面作业的id号。

再次输入 squeue。显示

JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)

说明作业已经取消。

参见